Biowissenschaften kurz notiert

Genscheren kombiniert mit RNA-Sequenzierung einzelner Zellen

Crispr-Droplet-Sequenzierung (Crop-seq) verändert gezielt das Erbgut von Zellen und analysiert direkt die genetische Aktivität. Die Methode kombiniert die Veränderung von DNA mit Crispr-Cas9 und Einzelzell-RNA-Sequenzierung. Damit untersuchen Wissenschaftler am Zentrum für Molekulare Medizin (CeMM) in Wien mehrere tausend Zellen parallel. Eine Genfähre macht die Crispr-Guide-RNA sichtbar, welche die Genscheren zur Schnittstelle im Genom führt. Die Sequenzierung zeigt anschließend, welche Gene in der Zelle aktiv sind. Bislang erfassten Screeningmethoden nur einfache Faktoren wie die Lebensfähigkeit. Um die Genexpression zu analysieren, mussten die Wissenschaftler die Zellen isolieren und einzeln untersuchen. Mit Crop-seq beobachten sie parallel für jede Zelle, wie die genetische Veränderung die Expression von mehr als 4000 Genen beeinflusst.

• ¹ P. Datlinger et al., Nat. Methods 2017, doi: 10.1038/nmeth.4177

Alissa Götzinger

Wissenschaft & Forschung